仲研：計算生物学／生命現象の数理モデル
仲研究室では広い意味では情報科学の生命科学への応用ということをやっています。バイオインフォマティクスあるいはシステムバイオロジーなどと呼ばれている分野と関連しています。簡単に言うとコンピュータを使った細胞や進化などの生命現象の研究です。他に数学教育にかかわるアプリの開発や人工知能（AI）関連の試作・調査なども行っています。社会に直ちに役に立つようなことより面白いことに価値をおいています。また、仲研では徒弟制度（チューター制）を採用しており、3年次のプレゼミでは4年生が取り組んでいる卒業研究のテーマのどれかひとつを手伝ってもらいます。ちなみに上の懇親会の写真の中9名が今年度の皆さんのチューターになります。昨年度の卒業生も映っています。
仲研の特徴
- 3年生と4年生が１対１で組んでチームで研究を行う（チューター制）
- プログラミング言語としてMathematicaを主に使う（テーマによってはPerl、C言語、CUDA、Pythonなども）
- 例年、教職課程の履修者が多い（卒業生にも教員多数）
- 懇親会が多い（月に1回程度、夏季休暇中の合宿やBBQなども）
主なテーマ概要
細胞内シグナル伝達系の数理モデルによる解析（本格派向け・学会発表）
その他の生命情報関連システムの調査・試作（マニア向け）
- 人工生命プログラム（生物進化シミュレーション、繰返し型囚人のジレンマ）
- 人工知能プログラム（囲碁・将棋、ディープラーニング）
その他のプログラム／Webアプリケーション開発（IT系就職・教職向け）
- ウェブアプリケーションの試作（数学教育支援、電子テキスト、テキスト管理）
卒業論文・修士論文一覧（タイトルをクリックすると内容をみれます。ただし、学外からはVPN接続が必要です。）
2026年度
- 仲研卒研スケジュール管理システムの作成：上田洸太（23RS026）
- 平面で立体を繰返し分割する過程を可視化する教育支援アプリの試作：大中春翔（23RS034）
- 高校数学の回転体の体積に関する教育支援アプリの試作：林勇輝（23RS111）
- AIエージェントフレームワークの比較研究：日隈憲治（23RS112）
- 高校数学の関数と共通接線の位置関係に関する学習支援アプリの試作：松原明音（23RS131）
- 矩形上の動点の位置を二次方程式を用いて求める学習支援アプリの試作：守永瑞穂（23RS139）
- AI関連ライブラリの調査と画像認識モデルの試作：山下登悠（23RS143）
- ３次元空間における囚人のジレンマゲームのMathematicaでの試作：吉田龍哉（23RS148）
- 微分方程式の数値解に関する教育支援アプリの試作：大曲由将（23RS604）
- 酵素反応ネットワークの双安定性の評価関数に関する研究：岩本拓巳（25GJK02）
2025年度
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2021年度
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